有機肥是主要來源于植物或動物，其中含有大量有機物質，能提供給農作物多種無機和有機養分，不僅能為農作物提供全面營養，而且肥效比較長，可增加和更新土壤有機質. 生物肥能促進土壤微生物繁殖，起到培肥改良土壤的作用。
化肥一般多是無機化合物，用化學或物理方法制成的含有一種或幾種農作物生長需要的營養元素的肥料?；实酿B分比較單純但含量高，通常土壤中的營養元素不能夠滿足農作物生長的時候，就會使用含有某些成分的化肥來補充養分，化肥的肥效快，費勁比較猛。
有機肥和化肥各有特點：
（l）有機肥料含有大量的有機質，具有明顯的改土培肥作用；化學肥料只能提供作物無機養分，長期施用會對土壤造成不良影響，使土壤“越種越饞”。
（2）有機肥料含有多種養分，所含養分全面平衡；而化肥所含養分種類單一，長期施用容易造成土壤和食品中的養分不平衡。
（3）有機肥料養分含量低，需要大量施用，而化學肥料養分含量高，施用量少。
（4）有機肥料肥效時間長；化學肥料肥效期短而猛，容易造成養分流失，污染環境。
（5）有機肥料來源于自然，肥料中沒有任何化學合成物質，長期施用可以改善農產品品質；化學肥料屬純化學合成物質，施用不當能降低農產品品質。
（6）有機肥料在生產加工過程中，只要經過充分的腐熟處理，施用后便可提高作物的抗旱、抗病、抗蟲能力，減少農藥的使用量；長期施用化肥，由于降低了植物的免疫力，往往需要大量的化學農藥維持作物生長，容易造成食品中有害物質增加。
（7）有機肥料中含有大量的有益微生物，可以促進土壤中的生物轉化過程，有利于土壤肥力的不斷提高；長期大量施用化學肥料可抑制土壤微生物的活動，導致土壤的自動調節能力下降。